mgkit
mgkit.align
mgkit.consts
mgkit.counts
mgkit.counts.func
mgkit.counts.glm
mgkit.counts.scaling
mgkit.db
mgkit.db.dbm
mgkit.db.mongo
mgkit.filter
mgkit.filter.common
mgkit.filter.gff
mgkit.filter.lists
mgkit.filter.reads
mgkit.filter.taxon
mgkit.graphs
mgkit.io
mgkit.io.blast
mgkit.io.fasta
mgkit.io.fastq
mgkit.io.gff
mgkit.io.glimmer
mgkit.io.snpdat
mgkit.io.uniprot
mgkit.io.utils
mgkit.kegg
mgkit.logger
mgkit.mappings
mgkit.mappings.cazy
mgkit.mappings.eggnog
mgkit.mappings.enzyme
mgkit.mappings.go
mgkit.mappings.pandas_map
mgkit.mappings.taxon
mgkit.mappings.utils
mgkit.net
mgkit.net.embl
mgkit.net.pfam
mgkit.net.uniprot
mgkit.net.utils
mgkit.plots
mgkit.plots.abund
mgkit.plots.boxplot
mgkit.plots.colors
mgkit.plots.heatmap
mgkit.plots.unused
mgkit.plots.utils
mgkit.simple_cache
mgkit.snps
mgkit.snps.classes
mgkit.snps.conv_func
mgkit.snps.filter
mgkit.snps.funcs
mgkit.snps.mapper
mgkit.taxon
mgkit.utils
mgkit.utils.common
mgkit.utils.dictionary
mgkit.utils.sequence
mgkit.utils.trans_tables
mgkit.workflow
mgkit.workflow.add_gff_info
mgkit.workflow.alg_utils
mgkit.workflow.blast2gff
mgkit.workflow.count_utils
mgkit.workflow.dict_utils
mgkit.workflow.edit_gff
mgkit.workflow.extract_gff_info
mgkit.workflow.fasta_utils
mgkit.workflow.fastq_utils
mgkit.workflow.filter_gff
mgkit.workflow.hmmer2gff
mgkit.workflow.json2gff
mgkit.workflow.pnps_gen
mgkit.workflow.sampling_utils
mgkit.workflow.snp_parser
mgkit.workflow.taxon_utils
mgkit.workflow.utils
